Merimasku kyrka är en korsformad träkyrka. Den stämningsfulla lilla träkyrkan ligger på en rätt hög ås i närheten av Merimasku sund och hör till vårt lands tidiga korskyrkor. Till planformen är den nästan en korskyrka med lika långa armar. Sakristian ligger i norra ändan av den norra korsarmen. Framför dörröppningarna i södra och västra korsarmen finns senare tillkomna förrum av bräder.
De rödmyllade ytterväggarna har en bred stående ytterpanel som är fäst med smidda spikar. Timmerväggarna är knuttimrade med långknut. I ytterhörnen skyddas knutkedjorna av en pilasterliknande vågrät brädfodring. Yttertaket är gjort av spån. Inne i kyrksalen har väggarna stående panel. Den randiga målningen imiterar marmor och är från år 1850.
Korsarmarnas välvda tunnvalv förenas i korsmitten. I västra och norra korsarmen finns läktare. Predikstolen i barockstil donerades år 1658 till församlingens föregående kyrka. Apostlaskulpturerna på dess korg är gjorda av träsnidaren Mathias Reiman, som var verksam i Åbo. På ljudtaket finns en uppmaning på latin: Förbannad vare den som gör Herrens verk lättjefullt.
Skåpuret är kännetecknande för kyrkorna i Åbotrakten, och kyrkskeppet föreställer en handelsfregatt. Båda är från början av 1800-talet. Den avlånga kyrkogården kring kyrkan sträcker sig i nord-sydlig riktning och omges av ett timmerstaket. Klockstapeln i dess nordvästra hörn är från år 1769. I det sydvästra hörnet finns ett knuttimrat porthus med sadeltak och i det sydöstra hörnet ett knuttimrat gravkapell från mitten av 1700-talet. Minnesmärket på de senaste krigens hjältegravsområde är utfört av Vilho Aalto.